科研人员创建精准N糖蛋白质组学分析方法

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新华社上海9月6日电(记者)生物医学科学研究院与化学系杨鹏远教授、中国科学院计算技术研究所何思敏研究员、国家蛋白质科学中心(上海)黄研究员共同发表了基于质谱的高通量糖基化肽分析方法pglyco2.0，为精确的N-糖蛋白质组学研究提供了新技术。

5日，相关研究成果发表在《自然通讯》上，标题为pglyco2.0:基于全面质量控制和一步质谱的精确N-糖蛋白质组学糖肽分析方法。

糖基化是最复杂的蛋白质后修饰之一。与其他蛋白质后修饰相比，糖基化不仅会产生宏观异质性，即每个蛋白质上可能存在多个后修饰位点；将会有大量的微异质性，也就是说，在每个位点可能有几十个甚至几百个不同的后修饰组。此外，糖链本身的电离效率很低。这些因素的结合使得糖基化分析的通量和质量远远低于蛋白质组学的常规分析水平。

杨鹏远、何思敏、蓝带领各自团队，通过对质谱条件的深入研究和测试，开发了基于阶跃能量的分步质谱方法，提高了糖肽鉴定的通量，开发了具有自主知识产权的pglyco2.0糖肽检索引擎，并从糖链、肽段和糖肽三个层面精确控制了糖肽数据库的检索，大大提高了N糖蛋白质组学分析的通量和质量。

此外，首次将重标准元素应用于糖肽鉴定的准确度分析，为该领域的质量控制分析提供了新的方法和标准。该研究报告了目前最大的糖基化数据集:在1%的假阳性率下，在小鼠的五个器官中鉴定出10，000多种N糖肽。